Un Byouma es un arma médica creada por los brujos antiguos para matar a los infectados o los que rodean a las personas infectadas y hacer que se vea como una enfermedad. Incluso siglos después de que los brujos murieran, estas armas siguen vagando por el mundo, infectando y matando gente. Narutaki Soutaro y Momo Izumo son "Doctores Sombra", entrenados para combatir estas Byouma a través de medios poco ortodoxos. Usar un equipo creado por arte de magia contra la Byouma médicos, en la que realizan "operaciones" para separarlos de sus anfitriones y destruirlos. Este trabajo en equipo con sus armas especiales, ¿es suficiente para deshacerse de todos los Byouma en el mundo?