¡La Misión T es una operación de inteligencia con la tarea de salvar al mundo de la ruina! El personaje principal es Negoro Botan, quien fue entrenada como ninja desde una edad temprana y criada como la mejor agente de inteligencia. Se une a otro agente de inteligencia, Kuruma, y asume la misión del destino del mundo. Su objetivo es recuperar la herencia del genio inventor Nikola Tesla, "Tesla Shards". ¿Podrán los dos cumplir su misión superando a otros agentes de otros países que apuntan a esos mismos fragmentos?